Интересная серия статей про клеточную и тканевую инженерию в The New York Times

искусственная трахея. Source: Harvard Bioscience via Time.com

На прошедшей неделе The New York Times  опубликовала серию из трех статей "Bodybuilders" о новейших достижениях в сфере клеточной и тканевой инженерии. Несмотря на то, что многие издания описывают их как материалы о стволовых клетках, очевидно, что автор и большинство исследователей и докторой, интервью с которыми приведены в статье, хотели донести совсем другую мысль. Они прежде всего акцентируют внимание на внеклеточном матриксе, который помимо структурно-механической функции выполняет еще и очень важную сигнальную функцию: "дайте организму правильный матрикс, а стволовые клетки сами придут и сделают новые здоровые ткани".

Coursera: еще больше университетов, еще больше курсов!

коллаж скриншотов с coursera.org

Coursera развивается бешеными темпами: только два месяца назад стали доступны курсы от 12 университетов, включая ВУЗы за пределами США, количество предлагаемых курсов перевалило за 120. Сегодня к проекту присоединились еще 17 университетов, среди которых университеты из Ivy League: Колумбийский университет (Columbia University) , Брауновский университет (Brown University). Кроме того заметно, что не только американские университеты видят будущее в Coursera, на этот раз к список пополнился университетами Мельбурна (University of Melbourne), Лондона (University of London), Еврейским университетом в Иерусалиме (Hebrew University of Jerusalem) и Гонг-Конгским научно-технологическим университетом (Hong Kong University of Science and Technology).

В патентном законодательстве США грядут очередные изменения.

Image credit:  http://v0nlaine.taba.ru/news

Прошел год с момента подписания America Invents Act - закона призванного реформировать патентное законодательство США. Но не смотря на большие ожидания и фанфары со всех сторон, в нем совершенно не затрагивались две огромные проблемы, с которыми столкнулись высокотехнологические компании: "патентные тролли" и патентование программного обеспечения. 

В августе Питер Дефацио (Peter DeFazio) и Джейсон Чаффетц (Jason Chaffetz) предложили незначительное изменение текущего законодательства в форме нового законопроекта Saving High-tech Innovators from Egregious Legal Disputes (SHIELD) Act, призванного прежде всего защитить компании от нападок патентных троллей. В соответствие с ним компании, производящие программное обеспечение и оборудование, могут полностью возместить судебные издержки в случае, если будет установлено, что подавший в суд держатель патента (ов) не имел "разумных шансов успеха на рынке".

Как я постигал основы фармакологии с Coursera

Многие, наверное, уже наслышаны про проект Coursera, который предлагает лекции известных университетов бесплатно. Меня он заинтересовал еще в апреле, но проблема была в том, что курсов по интересующим меня темам на тот момент было мало. Поэтому когда, Пенсильванский университет (University of Pennsylvania) объявил о том, что будет преподавать "Основы фармакологии" (Fundamentals of Pharmacology) через Coursera, я сразу на него записался. Ниже я постараюсь подробно описать как проходил курс.

Патентам на гены быть!

Не знаю как для вас, но для меня тот факт, что гены человека можно патентовать было весьма неприятным открытием. С одной стороны, с точки зрения обывателя это противоречит букве патентного законодательства, которое гласит, что нельзя патентовать объекты, существующие в природе. Но факт остается фактом, в течение последних лет фармакологические и биотехнологические компании успешно запатентовали около 20% всех описанных генов человека.

Понятно, что наиболее интересными в финансовом плане являются гены, связанные с распространенными заболеваниями. Так например, Myriad Genetics запатентовала гены BRCA1 и BRCA2, мутации в которых часто связывают с повышенной вероятностью возникновения рака груди. Способность выявления изменений в BRAC1/2 легло в основу диагностического продукта BRACAnalysis. К середине 2000-х сразу несколько компаний-конкурентов предлагало подобные тест-системы, и им были разосланы предложения заплатить за лицензирование BRAC.
На протяжение последних лет  сразу несколько компаний и общественных организаций пытались оспорить правомерность выдачи Myriad патентов на гены человека. В ходе последнего разбирательства в августе 2012 в очередной раз голосованием 2-1 было решено, что Myriad имеет полное право на выданные ей патенты. В своем решении судья Элан Лоури (Alan Lourie) написал, что "каждая из рассматриваемых молекул представляет собой субстанцию, которая не представлена в природе"  (“Each of the claimed molecules represents a nonnaturally occurring composition of matter.”)

• 
  

Ссылки по теме:

Господин не владеет собой (Гены всех людей оказались запатентованы)

Myriad Genetics BRCA1 and BRCA2 patents upheld in court

Prismatic - симпатичная читалка новостей

скриншот сайта Prismatic

Если верить GigaOM, то Prismatic открыл свои двери для широкой публики только сегодня (23 августа), хотя избранные пользовались сервисом уже на протяжение нескольких месяцев.

Что это такое? Это сервис для чтения новостей, но с одной изюминкой - алгоритм постепенно "умнеет" и сам предлагает статьи, которые могут понравится подписчику.

После того как Google начал играться и менять Google Reader, я начал задумываться, а что если его совсем поломают или, чего хуже, вообще прикроют (они там в Mountain View в последнее время много чего позакрывали).

Весь человеческий организм на чипе.

image credit: Futurama

Признаюсь, что пару лет назад, когда появились первые материалы о лёгком на чипе, доступные широкой публике, я упустил их из виду. Мой интерес к этой теме привлекло интервью с Дональдом Ингбером (Donald Ingber), директором института Уисс (Wyss Institute) при Гарвардском университете.

Начну издалека: все кто когда-нибудь работал с культурами клеток (те самые, что растут в красивой розовой жидкости в инкубаторах), не раз слышали критические замечания. Главный аргумент - результаты, которые мы получаем плохо соотносятся с процессами, реально происходящими в организме, потому что клетки, растущие в чашке Петри, представляют собой слишком упрощенную модель. Хорошо, говорите вы, давайте я буду проверять свою гипотезу на лабораторных животных. Но тут же получаете в ответ, что это слишком сложная модель, которая к тому же не всегда хорошо имитирует процессы, происходящие в организме человека.

Где же выход?

О проекте Coursera из первый уст (TED Talk)

В июле основательница Coursera Дафне Коллер выступила на конференции TED в Эдинбурге. Помимо информации, которая была уже известна из интервью с The New York Times, Fortune и другими изданиями, она рассказала интересного о том, как работает система и в чем ее координальное отличие от онлайн курсов на  в рамках проекта Open Courseware.

Калифорнийский университет-Беркли присоединяется к EdX

скриншот страницы EdX.org

Июль выдался необычайно богатым на события в сфере онлайн-обучения. На этот раз новости исходят от совместного проекта Гарварда и Массачусетского Технологического - EdX. Точнее, так он был представлен общественности в мае, на этой неделе к инициативе присоединился  Калифорнийский Университет - Беркли (UC Berkeley).

Через какие аэропорты во время эпидемии заболевания распространяются наиболее эффективно?

Группа из Массачусетского Технологического опубликовала исследование, в котором были смоделированы ранние этапы распространия заболеваний через международные аэропорты США в случае эпидемии. В основу заложены принципы сетевых моделей и реальные данные о перемещениях людей за  2007-2010 годы. Отмечается, что модель учитывает не только степень загруженности аэропорта и направления основных маршрутов, но и то сколько времени проводят пассажиры на его территории во время пересадки, а также прилета и вылета.

Выяснилось, что скорость распространения гипотетической эпидемии оказалась бы значительно выше, если ее очаг находится вблизи аэропортов Нью-Йорка, Лос-Анджелеса и Гонолулу.

Результаты исследования наглядно отображены в этом видео.