Pages

Monday, November 19, 2012

Как корейские ученые склонили клетки к самоубийству при помощи магнитного поля

апоптоз раковой клетки (source: JHSPH)

Не так давно в этом блоге уже описывались экзотические способы управления процессами в клетке, сегодня расскажу про еще один такой способ. Если в предыдущем случае учёные открывали и закрывали каналы и меняли уровень транскрипции гена, то в это раз уже другая группа вызывала апоптоз (разновидность запрограммированной клеточной гибели) в клетках при помощи магнитного поля. Как же им это удалось?

Saturday, October 20, 2012

Как я вспоминал статистику с Coursera

Начну с того, что статистику и её сестру биометрию я проходил (именно проходил) очень давно. С тех пор я успеил основательно забыть даже то, чему меня в свое время научили. В повседневной практике всем достаточно старого доброго t-теста Стьюдента, но времена, похоже, меняются и биологу в скором времени (да, и сейчас) тоже неплохо разбираться в статистическом анализе. В этом плане мне показалось, что курс Statistics One с профессором Andrew Conway из Принстонского университета пришелся как нельзя кстати.

Thursday, October 11, 2012

История Нобелевского лауреата Синья Яманака и фаворитизм научных изданий в пользу американских авторов.

Джон Гердон и Синья Яманака. Фото: ИТАР-ТАСС, АР
После получения Нобелевской премии имя профессора Яманака снова попало на страницы всех научных и новостных изданий, но в основном это описание его успехов в области стволовых клеток. Но есть одна сторона истории, о которой предпочитают умалчивать. 

В 2010 году New Scientist (The Stem Cells Wars, pdf) проанализировал более 200 публикаций в области стволовых клеток, датированных позднее 2006 года, и пришел к выводу, что известные научные издания "покровительствуют" американским ученым. Среди прочих приведен пример работы Яманака, публикация котораой была отложена редакцией Nature на 295(!) дней. И в последствие была опубликована одновременно с работами американских исследователей.


“All's fair in love and war, they say, but science is supposed to obey more noble ideals. New findings are submitted for publication, the studies are farmed out to experts for objective 'peer review' and the best research appears promptly in the most prestigious journals. 
“Some stem cell biologists are crying foul, however. Last year(2009), 14 researchers in this notoriously competitive field wrote to leading journals complaining of "unreasonable or obstructive reviews". The result, they claimed, is that 'publication of truly original findings may be delayed or rejected.' 
“Triggered by this protest, New Scientist scrutinised the dynamics of publication in the most exciting and competitive area of stem cell research, in which cells are 'reprogrammed' to acquire the versatility of those of an early-stage embryo. In this fast-moving field, where a Nobel prize is arguably at stake, biologists are racing feverishly to publish their findings in top journals. 
“Our analysis of more than 200 research papers from 2006 onwards reveals that US-based scientists are enjoying a significant advantage, getting their papers published faster and in more prominent journals (find our data, methods and analyses here). 
“More mysterious, given his standing in the field, is why two of Yamanaka's papers were among the 10 with the longest lags. In the most delayed of all, Yamanaka reported that the tumour-suppressing gene p53 inhibits the formation of iPS cells. The paper took 295 days to be accepted. It was eventually published by Nature in August 2009 alongside four similar studies. 'Yamanaka's paper was submitted months before any of the others,' complains Austin Smith at the University of Cambridge, UK, who coordinated the letter sent to leading journals. 
“Yamanaka suggests that editors may be less excited by papers from non-US scientists, but may change their minds when they receive similar work from leading labs in the US. In this case, Hochedlinger submitted a paper similar to Yamanaka's, but nearly six months after him. Ritu Dhand, Nature's chief biology editor, says that each paper is assessed on its own merits. Hochedlinger says he was unaware of Yamanaka's research on p53 before publication.”
По материалам  California Stem Cell Report

Monday, October 8, 2012

Серия подкастов по иммуногенетике.

По следам конференции по иммуногеномике (Nature Immunogenomics), проходившей в Нантсвиле, штат Алабама на прошлой неделе, университет Алабамы-Бирмингем запустил серию подкастов по этой теме

На прошлой неделе вышел подкаст с  директором центра клинической иммунологии и ревматологии Университета Алабамы-Бирмингем Луи Бриджесом (S. Louis Bridges). На этой неделе в пятницу выйдет интервью с человеком, стоявшим у истоков иммуногенетики Стивеном Куейком  (Stephen Quake).

1 неделя - Луи Бриджес (S. Louis Bridges), директор центра клинической иммунологии и ревматологии Университета Алабамы-Бирмингем

2 неделя -  Стивен Куейк (Stephen Quake), профессор факультета биоинженерии в Стэнфордском университете

3 неделя -  Кейси Уивер  (Casey Weaver), профессор факультета патологии  Университета Алабамы-Бирмингем

4 неделя -  Роберт Плендж (Robert Plenge), профессор Гарвардского Университета, директор подразделения генетики и геномики в отделении ревматологии, иммунологии и аллергии в  Brigham and Women’s Hospital.

Saturday, September 29, 2012

Интересная серия статей про клеточную и тканевую инженерию в The New York Times

искусственная трахея. Source: Harvard Bioscience via Time.com
На прошедшей неделе The New York Times  опубликовала серию из трех статей "Bodybuilders" о новейших достижениях в сфере клеточной и тканевой инженерии. Несмотря на то, что многие издания описывают их как материалы о стволовых клетках, очевидно, что автор и большинство исследователей и докторой, интервью с которыми приведены в статье, хотели донести совсем другую мысль. Они прежде всего акцентируют внимание на внеклеточном матриксе, который помимо структурно-механической функции выполняет еще и очень важную сигнальную функцию: "дайте организму правильный матрикс, а стволовые клетки сами придут и сделают новые здоровые ткани".

Wednesday, September 19, 2012

Coursera: еще больше университетов, еще больше курсов!

коллаж скриншотов с coursera.org
Coursera развивается бешеными темпами: только два месяца назад стали доступны курсы от 12 университетов, включая ВУЗы за пределами США, количество предлагаемых курсов перевалило за 120. Сегодня к проекту присоединились еще 17 университетов, среди которых университеты из Ivy League: Колумбийский университет (Columbia University) , Брауновский университет (Brown University). Кроме того заметно, что не только американские университеты видят будущее в Coursera, на этот раз к список пополнился университетами Мельбурна (University of Melbourne), Лондона (University of London), Еврейским университетом в Иерусалиме (Hebrew University of Jerusalem) и Гонг-Конгским научно-технологическим университетом (Hong Kong University of Science and Technology).

Tuesday, September 18, 2012

В патентном законодательстве США грядут очередные изменения.

Image credit:  http://v0nlaine.taba.ru/news
Прошел год с момента подписания America Invents Act - закона призванного реформировать патентное законодательство США. Но не смотря на большие ожидания и фанфары со всех сторон, в нем совершенно не затрагивались две огромные проблемы, с которыми столкнулись высокотехнологические компании: "патентные тролли" и патентование программного обеспечения. 

В августе Питер Дефацио (Peter DeFazio) и Джейсон Чаффетц (Jason Chaffetz) предложили незначительное изменение текущего законодательства в форме нового законопроекта Saving High-tech Innovators from Egregious Legal Disputes (SHIELD) Act, призванного прежде всего защитить компании от нападок патентных троллей. В соответствие с ним компании, производящие программное обеспечение и оборудование, могут полностью возместить судебные издержки в случае, если будет установлено, что подавший в суд держатель патента (ов) не имел "разумных шансов успеха на рынке".

Friday, August 31, 2012

Как я постигал основы фармакологии с Coursera

Многие, наверное, уже наслышаны про проект Coursera, который предлагает лекции известных университетов бесплатно. Меня он заинтересовал еще в апреле, но проблема была в том, что курсов по интересующим меня темам на тот момент было мало. Поэтому когда, Пенсильванский университет (University of Pennsylvania) объявил о том, что будет преподавать "Основы фармакологии" (Fundamentals of Pharmacology) через Coursera, я сразу на него записался. Ниже я постараюсь подробно описать как проходил курс.

Tuesday, August 28, 2012

Патентам на гены быть!

Не знаю как для вас, но для меня тот факт, что гены человека можно патентовать было весьма неприятным открытием. С одной стороны, с точки зрения обывателя это противоречит букве патентного законодательства, которое гласит, что нельзя патентовать объекты, существующие в природе. Но факт остается фактом, в течение последних лет фармакологические и биотехнологические компании успешно запатентовали около 20% всех описанных генов человека.

Понятно, что наиболее интересными в финансовом плане являются гены, связанные с распространенными заболеваниями. Так например, Myriad Genetics запатентовала гены BRCA1 и BRCA2, мутации в которых часто связывают с повышенной вероятностью возникновения рака груди. Способность выявления изменений в BRAC1/2 легло в основу диагностического продукта BRACAnalysis. К середине 2000-х сразу несколько компаний-конкурентов предлагало подобные тест-системы, и им были разосланы предложения заплатить за лицензирование BRAC.
На протяжение последних лет  сразу несколько компаний и общественных организаций пытались оспорить правомерность выдачи Myriad патентов на гены человека. В ходе последнего разбирательства в августе 2012 в очередной раз голосованием 2-1 было решено, что Myriad имеет полное право на выданные ей патенты. В своем решении судья Элан Лоури (Alan Lourie) написал, что "каждая из рассматриваемых молекул представляет собой субстанцию, которая не представлена в природе"  (“Each of the claimed molecules represents a nonnaturally occurring composition of matter.”)
Ссылки по теме:

Господин не владеет собой (Гены всех людей оказались запатентованы)

Myriad Genetics BRCA1 and BRCA2 patents upheld in court


Thursday, August 23, 2012

Prismatic - симпатичная читалка новостей

скриншот сайта Prismatic

Если верить GigaOM, то Prismatic открыл свои двери для широкой публики только сегодня (23 августа), хотя избранные пользовались сервисом уже на протяжение нескольких месяцев.

Что это такое? Это сервис для чтения новостей, но с одной изюминкой - алгоритм постепенно "умнеет" и сам предлагает статьи, которые могут понравится подписчику.

После того как Google начал играться и менять Google Reader, я начал задумываться, а что если его совсем поломают или, чего хуже, вообще прикроют (они там в Mountain View в последнее время много чего позакрывали).

Tuesday, August 21, 2012

Весь человеческий организм на чипе.

image credit: Futurama
Признаюсь, что пару лет назад, когда появились первые материалы о лёгком на чипе, доступные широкой публике, я упустил их из виду. Мой интерес к этой теме привлекло интервью с Дональдом Ингбером (Donald Ingber), директором института Уисс (Wyss Institute) при Гарвардском университете.

Начну издалека: все кто когда-нибудь работал с культурами клеток (те самые, что растут в красивой розовой жидкости в инкубаторах), не раз слышали критические замечания. Главный аргумент - результаты, которые мы получаем плохо соотносятся с процессами, реально происходящими в организме, потому что клетки, растущие в чашке Петри, представляют собой слишком упрощенную модель. Хорошо, говорите вы, давайте я буду проверять свою гипотезу на лабораторных животных. Но тут же получаете в ответ, что это слишком сложная модель, которая к тому же не всегда хорошо имитирует процессы, происходящие в организме человека.
Где же выход?

Wednesday, August 1, 2012

О проекте Coursera из первый уст (TED Talk)


В июле основательница Coursera Дафне Коллер выступила на конференции TED в Эдинбурге. Помимо информации, которая была уже известна из интервью с The New York Times, Fortune и другими изданиями, она рассказала интересного о том, как работает система и в чем ее координальное отличие от онлайн курсов на  в рамках проекта Open Courseware.

Thursday, July 26, 2012

Калифорнийский университет-Беркли присоединяется к EdX

скриншот страницы EdX.org

Июль выдался необычайно богатым на события в сфере онлайн-обучения. На этот раз новости исходят от совместного проекта Гарварда и Массачусетского Технологического - EdX. Точнее, так он был представлен общественности в мае, на этой неделе к инициативе присоединился  Калифорнийский Университет - Беркли (UC Berkeley).

Monday, July 23, 2012

Через какие аэропорты во время эпидемии заболевания распространяются наиболее эффективно?

Группа из Массачусетского Технологического опубликовала исследование, в котором были смоделированы ранние этапы распространия заболеваний через международные аэропорты США в случае эпидемии. В основу заложены принципы сетевых моделей и реальные данные о перемещениях людей за  2007-2010 годы. Отмечается, что модель учитывает не только степень загруженности аэропорта и направления основных маршрутов, но и то сколько времени проводят пассажиры на его территории во время пересадки, а также прилета и вылета.

Выяснилось, что скорость распространения гипотетической эпидемии оказалась бы значительно выше, если ее очаг находится вблизи аэропортов Нью-Йорка, Лос-Анджелеса и Гонолулу.

Результаты исследования наглядно отображены в этом видео.

Tuesday, July 17, 2012

Образовательный стартап Coursera вышел на новый этап развития. (обновление)


В последние полгода мы наблюдаем стремительное развитие образовательных проектов в интернете. Как правило, они либо напрямую связаны с знаменитыми университетами (EdX, Coursera), либо основаны известными профессорами, которые решили преподавать за пределами академических институтов (Udacity). И в обоих случаях успех проекта во многом определяется количеством и разнообразием курсов.

Friday, July 13, 2012

Бесплатные онлайн университеты. Что это такое? (инфографика)

За последний год появилась несколько заметных проектов в области бесплатного онлайн обучения. Видные университеты, объединяются в альянсы и предлагают свои курсы в интернете для всех желающих. Ярким примером служат EdX (Harvard+MIT) и Coursera (UPenn, Stanford, Princeton, University of Michigan).

Понравилась инфографика, которая неплохо рассказывает про открытые онлайн университеты, а также о плюсах и минусах такого подхода к обучению.

The World of Massive Open Online Courses
Presented By: Online Colleges

Wednesday, July 11, 2012

Подкасты о науке. Новости.

Как известно, ничто не стоит на месте. Я потихоньку поправлял свои предыдущие посты про научные подкасты по мере появления новой информации. Но так случилось, что в мае-июне произошло сразу несколько крупных изменений.

Friday, June 29, 2012

Как объяснить 11-летнему ребенку, что такое пламя?

скриншот с сайта Center for Communicating Science

Много лет назад Алан Алда, в то время ещё школьник, задал вопрос своему учителю: "Что такое пламя?" В ответ он получил сухое: "Окислительный процесс", которое конечно же не удовлетворило его любопытства.

Сегодня Алан, больше известный  как актер, режиссер и продюссер, входит в состав совета Center for Communicating Science, главная задача которого - показать (а в идеале и научить) ученых просто и увлекательно рассказывать о науке широкой публике.  В марте центр объявил конкурс на лучший ответ на вопрос 11-летнего Алана, который в свое время остался без удовлетворительного ответа. Участинки конкурса могли использовать любые выразительные средства для того, чтобы наиболее полно и в тоже время доступно ответить на жгучий вопрос "что же такое пламя?"

Saturday, June 2, 2012

Они меня посчитали, или ученым присвоят индивидуальные номера.

image credit: Flickr/Marco Ro
Приходилось ли вам искать в PubMed работы выходцев из Китая, задав только фамилию и инициалы? Если ответ утвердительный, то вы не по-наслышке знаете, что найти работы интересующего вас Вонга (Wang), Чжан (Zhang) или Ли (Li/Lee) почти также сложно, как иголку в стоге сена. Решение этой проблемы уже не за горами, Open Research and Contributor ID (ORCID) планирует уже в этом году ввести идентификационную систему, которая позволит различить авторов с однаковыми именами и фамилиями.

Tuesday, May 15, 2012

Микробиом человека

В современной биологии только ленивый не говорит про различные "-омы". Микробиологи не остаются в стороне от этих веяний и не только изучают отдельных микробов, но и пытаются "картировать" их место проживания и взаимодействие между собой и организмом-хозяином.
Журнал Scientific American опубликовал интересный схему, в которой отмечены доминирующие виды микроорганизмов в различных органах человека. Оригинал на сайте интерактивный, так что рекомендую пройти по ссылке, если интересно почитать больше про самих микробов.

источник: Scientific American

Wednesday, May 9, 2012

Радиоуправляемые гены.

Этот заголовок в твите журнала Science cразу привлек мое внимание. Подумать только - контроль генов на расстоянии при помощи радиоволн!!! (правда, если подумать чуть-чуть подольше, то становится немного страшно:)
Но заголовки бывают обманчивы, поэтому обратимся к оригинальной статье.




Saturday, May 5, 2012

H5N1. Первая "секретная" статья вышла в печать.


image credit: M.Kemp/Rubberball/Getty
На этой неделе в открытом доступе появилась статья, публикацию которой пытались запретить американские чиновники, да и вообще вокруг нее и сходной статьи в Science было много шума. Журналисты в научно-популярных изданиях шутили, что это самая известная из неопубликованных статей.

Историческое событие случилось 3 мая, 2012 года. Журнал Nature опубликовал полную версию работы группы Йосихиро Каваока (Yoshihiro Kawaoka) из университета Висконсина-Мэдисон "Experimental adaptation of an influenza H5 HA confers respiratory droplet transmission to a reassortant H5 HA/H1N1 virus in ferrets".

Что же такого было в статье, что почти поставило под угрозу сам факт её публикации?

Wednesday, May 2, 2012

Гарвард и Массачусетский Технологический объявили о запуске совместного онлайн проекта edX


Два известнейших американских университета - Гарвард и Массачусетский Технологический объявили сегодня, что запускают открытую образовательную платформу edX. По сути, Гарвардский Университет добавляет свои курсы к  уже действующей онлайн инициативе от MIT - MITx. В будущем организаторы не исключают добавления материалов других университетов.

Monday, April 30, 2012

Наличие стволовых клеток - предшественников яйцеклеток заставляет по-новому взглянуть на проблемы репродукции. Часть 1: Джонатан Тилли идёт против догмы.

                                                            
Слева направо: Генрих Вильгельм Вальдейер, Соломон Цукерман, Джонатан Тилли.
  Image credit: wikipedia.org,  solociencia.com
Работы последних лет в области оогенеза (процесс формирования яйцеклеток), очень напомнили мне, то время, когда я впервые узнал о существовании нервных стволовых клеток. Представьте, что тебе учитель биологии и все учебники на протяжении нескольких лет говорят, что нервные клетки не восстанавливаются, а тут все это оказывается, что все это совсем не так.


Но вернемся к яйцеклеткам. В школе и в университете нам говорили, что новые яйцеклетки у млекопитающих прекращают формироваться вскоре после рождения, и замирают на низком старте до наступления половой зрелости, наступлением которой они получают сигналы к окончательному созреванию.

Friday, March 30, 2012

2011 - Арабская весна. 2012 - Академическая весна.

Начало прошлого года ознаменовалось волной революций в арабском мире, в результате которых были свергнуты диктаторы, которые слишком долго находились у власти. Журнал The Economist, сравнивает протест ученых против Elsevier c "арабской весной". Возмущенные ученые тоже используют Twitter и Facebook для распространения информации и для согласования своих действий.  Их Мубарак и Кадаффи в одном лице - издательство Elsevier, их площадь Тахрир - сайт The Cost of Knowledge. Отличие в том, что о развитии событий и скромных победах научного сообщества почти никто не говорит, как будто дело остановилось на стадии объявления бойкота. А успехи есть! 

Friday, March 23, 2012

Подкасты о науке на русском языке




В iTunes великое множество подкастов о науке на английском, начиная от версий научно-популярных радиопрограмм до узкоспециализированных дайджестов академических изданий. К сожалению, с подкастами на эту тему на русском языке дело обстоит не так хорошо. Но не может же их просто не быть?!  Несколько месяцев назад я задался целью найти достойных представителей жанра на русском языке. Ниже результаты этого поиска.

Saturday, March 17, 2012

Научная песенка про пиво (и последствия его употребления!) /(A Biologist's) St. Patrick's Day Song

Из этой задорно-образовательной песенки вы узнаете о том, откуда берется пиво, а также о его влиянии на наши организмы. Словами описать сложно, смотрите сами!

С днем св. Патрика всех ирландцев и сочувствующих!

Friday, March 16, 2012

Эволюция Луны (NASA | Evolution of the Moon)

Космический центр Годдард (НАСА) создали компьютерную модель эволюции нашей соседки Луны в последние несколько миллиардов лет. Столкновения с астероидами и извержения вулканов прорисованы не хуже, чем в приличном фильме, но в отличие от последних несет в себе образовательный элемент.

Friday, March 9, 2012

Как правильно цитировать твиты в академической литературе



Твитер становится полноправным источником информации, а не только известий о  том, что ели на завтрак ваши друзья.  В связи с этим встает проблема цитирования этого источника академических изданиях. Решение предложила Modern Language Association.


Правила следующие:

Фамилия, Имя (имя аккаунта). "текст твита." Дата, время. Tweet.


Например, цитирование моего остроумного предпраздничного твита  в академическом журнале выглядело бы так:

Kolupaev, Oleg (okolupaev). "I'm convinced guys  knew 23d Feb is Men's day in Russia. "The human Y chromosome is here to stay.” 22 February 2012, 9:17 p.m. Tweet

Если настоящее имя неизвестно или это организация, то вместо имени пишется соответствующий псевдоним или название организации.


Например, ссылка на твит журнала Science выглядела бы так:

Science Mag News (ScienceNOW). "How to Say 'In Your Face' Like a Penguin ." 9 March 2012, 3:03 p.m. Tweet

В тексте работы необходимо передать содержание твита целиком. Например,

Science Mag News нашел ответ на вопрос, как сказать "Вот так тебе!" по-пигвински. 

Понятно, что это не единственный возможный вариант цитирования, а скорее первая попытка стандартизировать. В будущем, было бы логично предположить появление ссылки на сам твит, но до тех пор пока twitter не станет архивировать сообщения, это практически бесполезно.


Все еще сомневаетесь, что в Twitter есть люди достойные цитирования?

Тогда рекомендую ознакомится с этим комиксом:-)



Image credit: Creative Education, PHD Comics

Friday, March 2, 2012

Почему современная патентная система США не работает?

Патентное законодательство США в его текущем виде, не просто не выполняет своей первоначальной задачи, а наоборот препятствуют появлению инновационных продуктов и сервисов. А мнение высказывали как журналисты, так и инвесторы. Совсем недавно Кирви Фергюсон посвятил этой проблеме четвертый эпизод мини-сериала "Все вокруг - ремикс" (Everything is a remix).

Friday, February 24, 2012

Цензура статей об H5N1: Happy end?



image credit: laboratorytalk.com

На этой неделе в ВОЗ ученые определяли судьбу теперь уже знаменитых статей об H5N1, поданных в Nature и Science. Мероприятие открыл Пол Кейм (Paul Keim), представитель от NSABB (ational Science Advisory Board for Biosecurity), следующими словами:

“No one should presume to know all the ways in which influenza virus could be misused, and the motivations for doing so, but the consequences could be catastrophic. There are many scenarios to consider, ranging from mad lone scientists, desperate despots and members of millennial doomsday cults to nation states wanting mutually assured destruction options, bioterrorists or a single person's random acts of craziness. These are low-probability events, but they could introduce a new evolutionary H5N1 seed into the environment that seems not to exist in nature. This might not cause a pandemic instantly, but it could start the virus on a new path for pandemic evolution.”

Sunday, February 19, 2012

Все вокруг -ремикс (Everything is a Remix)


Поразительная находка этой недели - серия коротких видео Everything is a Remix, снятая Кирби Фергюсоном (Kirby Ferguson). Серия состоит из четырех эпизодов, цель которых проиллюстрировать одну очень простую идею: все новые идеи не возникают из неоткуда, а строятся на основе старых. Этот процесс происходит в три стадии: копирование, изменение, сочетание. (Copy. Transform. Combine). Эта очень простая и трезвая идея, которая почему-то никак не доходит до руководства транснациональных компаний и правительств разных стран,  готовых бесконечно говорить о том, как важны инновации. При этом сами препятствуют им -нельзя изобрести что-то новое, не сделав первый шаг - копирование. А этим все очень недовольны: компания А тратит огромные суммы, чтобы засудить компанию S, которая имела наглость создать тонкий планшетный компьютер прямоугольной формы, Палата представителей и Сенат США пытаются принять законы, направленные на борьбу с пиратством, правда при этом ломается сама архитектура интернета, но это их не волнует.

Sunday, February 12, 2012

Ученые против Elsevier.



В течение нескольких недель в твитер то и дело просочится сообщение из блогов про бойкот издательства Elsevier, но сейчас, похоже, дело приобретает серьезный оборот. Все началось с объявления бойкота издательству в личном блоге профессора математики Тимоти Гауэрса (Timothy Gowers). Он выдвигает следующие претензии:

Wednesday, February 8, 2012

Wolfram Alpha теперь умеет анализировать данные!

screenshot WolframAplha.com 
Любимый многими поисковик знаний ("knowledge engine") Wolfram Alpha  отличает от Google/Яндекса и Википедии

  • краткая и очень структурированная форма выдачи информации
  • ответы черпаются из проверенных и курируемых базах данных (например, GenBank для генов)
  • возможность обработки данных  (в моем случае это часто статистика): до сегодняшнего дня вопрос задавался либо в виде текста, либо числовой последовательности

Подробнее об Wolfram Alpha на русском можно прочитать здесь

8 февраля Wolfram Alpha открыл платный сервис Wolfram Alpha Pro, который не только позволяет использовать изображения, HTML код, данные в виде чисел или таблиц, а также более 60 различных форматов файлов (CSV, XML, WAV ...). В качестве приятного бонуса стоит упомянуть расширенную клавиатуру с греческими буквами.

Но самое интересное, что после того, как вы загрузили свои данные на сервер, сервис начнет их анализ и предложит варианты визуализации результатов. Если график выглядит не так, как вам хотелось бы, то это всегда можно подкорректировать "налету", потому что с все визуальные данные интерактивны (3D, анимация и дополнительный анализ).

Если в процессе анализа Wolfram Alpha использовала данные своих партнеров, то вы можете загрузить их в удобном для себя формате. К сожалению, эта функция будет доступна не для всех видов запросов из-за особенностей лицензионных соглашений с поставщиками информации.

Как и в обычных программах (типа Excel) в графиках можно менять стили, цвета и прочие настройки. Изображения сохраняются как векторном так и растровом форматах, что порой бывает весьма полезно. И, наконец, результаты целиком можно сохранить для использования офлайн (печати, презентаций и прочего) в интерактивном формате CDF, или старом добром PDF.

Почти забыл сказать, цена вопроса $4.99 в месяц (или $2.99 в месяц для студентов). Правда, дают попользоваться первые 2 недели бесплатно.

Видео с демонстрациями возможностей и подробный обзор на ангийском здесь 

Saturday, February 4, 2012

Клетка в 3D

Среди 16 лучших наглядных представлений науки, обнаружил вот такую 3D модель эукариотической клетки. Она прежде всего интересна тем, что визуально "упрощает" клетку, что дает четкое представление о том, какой объем занимают органеллы в разных клетках. В обычных моделях, приближенных к реальности, это не так просто оценить. Смотрите сами.

Friday, January 27, 2012

Наука и техника прошлого столетия глазами фотографа

So many tubes (photo: life.com)

Сегодня журнал Life опубликовал галерею избранных работ мастера научной фотографии Фритца Горо (Fritz Goro), который работал на издание в 30х-60х годах прошлого столетия. Его называют изобретателем макрофотографии, открывшей читателям совершенно новый мир.

В его работах отражен период в истории, когда люди восхищались наукой, и верили в ее безграничные возможности. 
Фотографии: Check the Water (слева) и The Ultimate Building Block (справа)
Вся галерея фотографий





Wednesday, January 25, 2012

Каких новостей науки ждать в 2012? (научные предсказания на 2012, по материалам Science и не только)


Wikipedia. Author Lucas Taylor
Пока на дворе все еще январь, то не поздно опубликовать, чего же нам ждать в 2012?

Бозон Хиггса

Это даже не предсказание - из декабрьской пресс-конференции в ЦЕРН, стало ясно, что в этом году мы точно узнаем, существует ли на самом деле "божественная" частица или нет. Данные, которые получат физики в 2012-м, позволят поставить точку в этом вопросе. На сегодняшний день физики могут только точно сказать, где его надо искать.




Friday, January 20, 2012

Авторы статей об H5N1, подвергшихся цензуре, опубликовали открытое письмо.

Dr. Yoshihiro Kawaoka
Dr. Ron Fouchier

Только я подумал, что можно на некоторое время поставить логическую запятую в истории с цензурой статей об H5N1 в Science и Nature, как тут выходит официальное обращение авторов обеих статей.

В нем они заявляют следующее:

Thursday, January 19, 2012

H5N1. Продолжение истории.


История с публикациями, описывающими штаммы вируса гриппа H5N1, которые потенциально могут передаваться от человека к человеку воздушно-капельным путем, получила не этой неделе продолжение. Nature попросила 10 специалистов из разных стран высказать, что они думают об этой ситуации. Что интересно, первых комментарий принадлежит самому автору работы, Рону Фушье (Ron Fouchier). Один из поводов его возмущения - доминирование мнения правительства одной страны в вопросе, который касается всего мирового сообщества.

Там же можно прочитать мнение вирусолога из Гонг-Конга (Kwok-Yung Yuen), а также услышать голос специалистов по вопросам биобезопасности.

Очень рекомендую почитать и другие комментарии, если вы следите за развитием этой истории.

Thursday, January 12, 2012

Проблемы с патентами (инфографика)


Я уже писал про состояние патентного законодательства в США, где приводил ссылку на  эпизод This American Life "When Patents Attack" Недавно обнаружил, что по его мотивам FrugalDad.com нарисовал замечательную инфографику. По причине внушительных размеров, убрал ее под кат.

Sunday, January 8, 2012

Вирус H5N1, цензура и биологическая безопасность.


NSABB website


В этой истории, разразившейся на рождественской неделе, смешалось столько разных острых тем и столько разных мнений, что просто голова кругом идет.

Все началось с того, что две группы исследователей: европейская под руководством Рона Фушье (Ron Fouchier) и американская, возглавляемая профессором Йошихиро Каваока (Yoshihiro Kawaoka), создали штаммы вируса H5N1 (птичий грипп), которые потенциально способны передаваться от человека к человеку  воздушно-капельным путем (эксперименты проводились на одном из любимых объектов вирусологов - хорьках). При этом, как утверждает Nature News, эти штаммы обладают такой же высокой вирулентостью, как вирус H5N1 дикого типа. Ученые подали свои статьи в известнейшие научные журналы "Nature" (Kawaoka) и "Science" (Fouchier). И вот в конце декабря Национальный научный совет по биобезопасности (National Science Advisory Board for Biosecurity (NSABB) США отправляет главным редакторам обоих журналов и авторам статей следующее заявление:

Thursday, January 5, 2012

Научные прорывы 2011 года (по версии Science)


В конце года принято подводить всевозможные итоги. Журнал Nature опубликовал 10-ку людей, которые попали в заголовки научных изданий в 2011. Другой популярный журнал - Cell- устроил 10 дневный марафон на свой странице в Facebook. Каждый день они постили по одной ссылке на ключевые статьи 2011-го, напечатанных на страницах журнала.
В Science поступили проще - посвятили целый номер итогам года. Среди них статья со скромным названием "Прорывы 2011-го"